Основан в 1972 г. для исследований распределения гидробионтов, миграций и особенностей поведения рыб в Камском и Воткинском водохранилищах. Комплексные многолетние исследования гидрофауны (рыб и водных беспозвоночных) проводятся на водных объектах в бассейнах рек Камы, Белой, Вятки, Урала, Северной Двины. По рекам Вятского бассейна составлен биологический ресурсный кадастр. Большое внимание уделяется работам, направленным на сохранение численности редких и исчезающих видов рыб: тайменя, стерляди, ручьевой форели. Помимо выполнения ресурсных и биоценотических исследований изучалось влияние минеральных взвесей сточных вод дражных разработок на гидробионтов, разрабатывались предельно-допустимые концентрации загрязняющих веществ (фталиевая и адипиновая кислоты, ванадий, цирконий, капролактан, ДКС-экстендер, сайпан, сайдрил и ряд других) для рыбохозяйственных водоемов. В конце 1970-х – начале 1980-х гг. начались работы по разработке биотехники для индустриальных методов разведения рыбы в условиях Урала. Благодаря работам Пермского филиала «ВНИРО» в Пермском крае получили развитие такие направления рыбоводства, как форелеводство, осетроводство, индустриальное рыбоводство.